新鮮組3代目総長に就いたのが、暴力とヤクザを嫌う近藤静也。彼は昼は堅気の会社員、夜はヤクザの総長として生きている。日本最大の暴力団、鬼州組との戦いで勝利を収めたが、立場の違いにより恋人の明美と別れてしまった。そこで静也は、抗争をなくすためには鬼州組を壊滅し、日本を統一するしかないと考えていた。 //そんな中、新鮮組はどんどん勢力を伸ばしていき、さらにはSNSでも人気を集め警察も手出しができない状況に。これをみた鬼州組総長の海腐は、新鮮組と平和同盟を組むことを決める。しかしその一方で、鬼州組の一部にはどんな手段を使ってでも和平を壊すと意気込む者も… //果たして、和平は予定通り為されるのだろうか。

静也は、鬼州組総長の海腐を信じ、和平を前向きに進めることに。しかし、鬼州組内部の和平に反対する者たちは、誰でも殺すと名の知れている殺し屋“J”の協力を仰ぎ、和平の前に新鮮組全員を殺すよう目論んでいた。 //その一方、以前公園で助けた女子高生の彩子が突然、静也の会社を訪れ、パフェを食べに行くことに。そこで、彩子の父がヤクザであるということを知る。その帰り道、静也は殺し屋Jに襲撃される。危機一髪で逃れることができたものの、和平まであと3日。果たして無事、和平を結ぶことができるのだろうか…？

和平まであと3日に迫る中、静也の自宅にJが襲撃する。静也は超臆病で小心者の生倉が住む、厳重体制の敷かれた家に潜むことに。しかし、複数のトラップを回避し、Jが襲撃にやってくる。危機一髪、静也は殺されずに生き残る。その一方で静也は、殺すチャンスがあるにもかかわらず、殺さないJに違和感を持つように…。 //そんな中、ついに和平当日に。順調に和平の契りを交わしている最中、突然鬼州組幹部であり、かつ、Jに静也を殺すよう仕向けていたはずの人物が殺されてしまう。そのため、海腐は激怒し、新鮮組を殺すよう子分に命じる。なぜ、Jは鬼州組幹部を殺したのか？その裏にある真実とは一体…！？

警察官の川路は、和平式の裏口の映像の様子から、襲撃が新鮮組ではない他の誰かがJを雇って襲撃させ、海腐に火をつけることで抗争に持ち込もうとしているのではないかと勘付く。 //しかし、川路の上司は、真実を突き詰めるのではなく、抗争を止め、市民の安全を守ることが警察の役目であるとし、引き続き新鮮組を取り締まるよう命令。そのため川路は、静也の会社を訪れて新鮮組の無実を証明する映像を渡す。しかしその帰り道、静也がヤクザだということに気づいた彩子が彼の元を訪れるが、Jに襲われてしまう。静也は彩子を守ろうと必死に戦うものの、Jに追い詰められる。その時、彩子が銃でJを射殺し危機を逃れる。動揺する彩子を守るため、静也は自ら容疑を被り、逃亡生活を送ることに。

静也の行方は分からずじまい、さらに鬼州組は関東へ進行して抗争へ。海腐の思惑通りに事が進み、新鮮組を消し去ろうとしていた。一方新鮮組は、幹部である鳴戸、猪首が総長静也の濡れ衣を晴らすために動く。そして二人は生倉、肘方に総長代理として新鮮組の指揮を任せ、鬼州組の侵攻を防ぐように伝える。鳴戸と猪首は目撃者である彩子に接近して証言を引き出さなければいけなかったが、警備が厳重で親族以外立ち入り禁止であり、顔が知られている新鮮組はなおさら近づけなかった。そんな中、ちょうど訪ねてきた秋野明美に協力を求める。一方の静也は会社の部長の家に嘘をつき匿ってもらうことに。 //一体新鮮組、静也の運命は如何に…？！

話を聞きに行った帰り、明美が病院でヤクザらしき人を見たことを伝えると、鳴戸、猪首は鬼州組が彩子を狙っている事に気づく。そしてすぐさまUターンし彩子を助けに向かう。到着するとすでに警官は殺されていた。そして鬼州組と戦うことになるがなんとか彩子を助けることに成功する。しかしその事件は新鮮組に罪をなすりつけるための罠だった。まんまと罠にハマった新鮮組は警官4名の殺害で組員に逮捕状が出され、幹部、組員が逮捕され、どんどん傘下の組が離脱していった。そのことを隠れている静也はニュースを見て知る。動揺が隠せない静也だったが、組員のために総長として覚悟を決める。

静也は一人で鬼州組に乗り込み、海腐だけでも潰そうとしており、警察官である川路の元を訪れる。一方の新鮮組も鬼州組にカチコミをかけようとしていたのである。他方では、生倉と肘方が鬼州組の幹部の胡麻田を発見する。川路と共に大阪に向かっていた静也だったが途中で川路は新鮮組の拠点に向かう。静也は鳴戸や猪首、組員らと再会することになる。静也は組員らも鬼州組にカチコミをかけに行こうとしていることを知り、組員らと海腐を倒しに向かうことに。生倉、肘方が離れていたはずの新鮮組の組員、そして鬼州組の組員である胡麻田も新鮮組に引き入れて戻ってくる。静也はいざ海腐を倒しに大阪に向かうのであった…

真正面から乗り込んでいく新鮮組。静也は海腐との戦いで勝利する。指名手配となっていた静也は新鮮組を幹部たちに任せ、警察に出頭するが彩子が静也を守るためにJを殺したと自首してきたことにより指名手配は取り下げられていた。彩子のことは正統防衛に持っていくという川路。全てが終わった静也は会社員とヤクザの日常に戻るのだった。 //その一方で生き残った海腐は打倒新鮮組に闘志を燃やす。この先、鬼州組はどうなっていくのだろうか。 //新鮮組、そして総長静也はこの先日本統一をすることはできるのだろうか…