メリーがアメリカ初の女性大統領に就任した直後、副大統領ルナが他界。サイラスが後任に決まると、メリーは超党派コンビを前面に出し、亡きフランキーの公約である大学無償化の実現に向けて動き出す。オリヴィアは票固めのため、反対派であるマイケルズ上院議員のスキャンダルをネタに恫喝し、難なく賛成派に転じさせていた。一方、ローワンはB613を再建する野望をオリヴィアに阻まれ、すっかり骨抜きにされており……。

メリーはバシュランのラシャド大統領を迎えて、中東和平の足掛かりとなる核合意を取り付けようとしていた。オリヴィアは合意に持ち込むため、ラシャドの身辺をジェイクに探らせる。ラシャドがめいヤスミンを偽名で有名大学に留学させていることを突き止めたオリヴィアは、ヤスミンの情報を使って揺さぶりを掛ける。一方、サイラスは晩餐会で大口献金者のフェントンと隣同士になるが、その傍若無人な振る舞いに我慢できず……。

8年間の任期を終えて一般人に戻ったフィッツ。気ままなひとり暮らしにわびしさを覚えるフィッツだったが、「フィッツジェラルド・グラント大統領図書館」建設に向けて、マーカスとの二人三脚が始まった。しかし、順調だった2人の関係が徐々にきしみ始め、寄付金集めをきっかけにマーカスの不満が爆発する。同じころ、フィッツ邸にローワンが姿を現わし、オリヴィアがB613を復活させて司令官になっていると告げ……。

オリヴィアはフィッツがワシントンD.C.に戻ってきたことに困惑していた。フィッツは黒人の少女が行方不明になっている問題を解決するためだと説明。オリヴィアに協力を求めるが、核安全サミットの準備があるオリヴィアはクインの事務所QPAに持ち込むように言ってフィッツを突き放す。一方メリーとラシャド大統領は、お互いに惹かれ合っていた。バシュランの敵国ダカールのナザリ首相は、そんな2人に不信感をあらわにする。

オリヴィアはローワンがフィッツを抱き込んでいたことに激怒。オリヴィアの暴走を案じたフィッツは、メリーにルナ・ヴァルガスの死の真相やB613について話す。何も知らなかったメリーは、オリヴィアにB613を閉鎖するように言う。同時にメリーは、ラシャドを助けるためにバシュランへの軍事介入を画策。ラシャドがカーティスの番組に出演し独裁者のイメージを払拭したことで、開戦に賛成する議員が増加したものの……。

クインとチャーリーの結婚式前夜。クインに呼び出されたオリヴィアは、ラシャドとヤスミンを殺したと責め立てられる。オリヴィアは苦渋の決断だったと潔く認め、クインが大事にすべきはチャーリーとおなかの子どもだとくぎを刺す。翌日、結婚式会場にクインが現われない。結婚におじけづき逃げ出した可能性が浮上するが、クインのパソコンからラシャド暗殺の捜査資料が発見され、暗殺犯による拉致の可能性が濃厚になり……。

事務所ではクインの無事を祈りつつ、最悪の場合を想定してモルグや病院で身元不明者を調べる作業が始まる。アビーはハックとチャーリーを支えながら、今までつかず離れずできたデイヴィッドの存在の大きさを再認識する。一方、メリーは核協定の調印式に向けてインタビューをこなす日々。そんな中、マーカスがフィッツと進めている刑事司法改革に支持率アップ確実なメリーを巻き込もうと、ホワイトハウスに乗り込んできて……。

盗難車のトランクから遺体が見つかる。燃やされていて身元確認はできないが、トランクから採取された血液や毛髪がクインのものと一致する。ハックは、クインの死体検案書に記載されていたヘアピンが、スミソニアン博物館からオリヴィアが借り出したものだと知る。そんな中、チャーリーの提案でクインは土葬にはせず、遺灰を弾丸に込めて発砲することになる。オリヴィアは弔辞の言葉を必死で考えるが、何も思い付かず……。

オリヴィアから自由と恐竜の骨を取り返すために、クインを拉致したローワン。しかし、オリヴィアがすぐに取引に応じず、交渉は決裂。ローワンは3日を過ぎたらクインを殺すと、オリヴィアに宣言する。その後、ローワンは量販店で店員マーヴと懇意になる。人のいいマーヴは失業中だと言うローワンに、自分の店で買い物をするときは自分名義の従業員割引を使えるようにすると言う。早速ローワンは、マーヴ名義で銃を購入して……。

オリヴィアはフィッツとバーモント州でロマンティックな週末を過ごすつもりだったが、そこにはハックやアビーの姿があった。クインが残したUSBメモリーに録音されていた会話から、オリヴィアがラシャドを暗殺したことが判明し、それに気付いたクインを口封じのためにオリヴィアが殺したと誰もが考えていた。フィッツらは、ダークサイドに落ち暴走するオリヴィアを軟禁して、首席補佐官辞任とB613の解体を迫り……。

オリヴィアはジェイクが首席補佐官になることを阻止するために、B613のシステムをダウンさせる。さらにジェイクの妻ヴァネッサの不倫相手ロバート・バコールをロシアのスパイに仕立て上げ、ジェイクの信用を失墜させる策に出る。窮地に立たされたメリーとジェイクにサイラスが打開策を提案。それに従ってテレビのインタビュー番組に出たヴァネッサは、バコールとホテルで密会していたのはCIAの囮捜査の一環だったと話す。

首席補佐官を辞めてから、オリヴィアは大学で危機管理についての特別授業をしている。聴講していたフィラデルフィアの刑事被告人弁護士であるアナリーズは、授業の後オリヴィアに声を掛け、貧しい黒人が原告の集団訴訟を連邦最高裁判所に持ち込むのを手伝ってほしいと頼む。アナリーズ個人に夫殺しや放火疑惑など不穏な要素が多いことを懸念するオリヴィアだったが、フィッツの財団を巻き込んで最高裁を目指すことに……。