オハイオ州クリーヴランドで8歳の少女サマンサが自宅前で誘拐された。クーパーの"レッドセル"チームが事件解決のため現場に到着すると、9日前にイーストクリーヴランドで8歳の娘アイーシャが誘拐されたと母親が訴えにきた。チームが2件の誘拐事件を捜査していく中、過去9か月の間にさらに2件の誘拐事件があったことがわかる。そんな中、過去誘拐された少女たちが遺体で見つかった。BAUはサマンサとアイーシャを無事発見することができるのか。

オハイオ州シンシナティの高級ホテルで、2週間のうちに男が3人刺殺される事件が発生。防犯カメラに映っていた共通の女性がいたことから、BAUは女性の連続殺人犯だと目星をつける。その一方、今度はナイトクラブのVIPルームで4件目の殺人事件が起こる。チームは捜査を進めるうち、4年前に起きたマーカス・グレアムの事件と関連していることに気付く。一連の殺人事件はこの凶悪犯が刑務所にいながら彼の服従者を操って起こしたものなのか。

アリゾナ州ツーソンの駐車場で、眼球をくり抜かれた男の遺体が見つかった。現場に入ったBAUのメンバーは状況から犯人は女だと特定しプロファイリングを進める。くり抜かれた眼球が地方紙の新聞販売機の中から発見され、その新聞には、被害者がヒザを手術するはずの病院で合併症によって亡くなった男性の記事が載っていた。クーパーはこの殺人自体に犯人からのメッセージがあると感じ取る。この時、病院では更なる殺人事件が起きていた。

イリノイ州シカゴで、高層ビルから無防備な市民を無差別に狙う長距離連続殺人事件が発生した。9日間で3人が殺害され、4人目の犠牲者がでたところで、優秀な狙撃手でもあるミックに期待した長官がレッドセルに出動命令を出した。BAUが出したプロファイルに合う狙撃手は、記録も訓練歴もない"ゴースト"だが腕前はプロであるということがわかる。そんな中、ミックの素性を調べた犯人がミック宛にポケベルを送りつけ、次の銃撃事件を予告してきた。

ヴァージニア州フレデリックバーグにある高校でパイプ爆弾が爆発し、多数の死傷者が出た。FBI長官の指名でクーパーのチームが捜査にあたるが、具体的な容疑者は見つからない。しかしクーパーは、事件当日の朝に学校に届けられていた声明文と、爆発現場の瓦礫の中から発見されたパイプ爆弾の破片に書かれていたのは、旧約聖書のアブラハムとイサクの言葉ではないかとひらめく。一方、犯人は着々と息子たちを使って、次なる爆破計画を実行しようとしていた。

ネブラスカ州オマハで、誕生日を祝っていた男がトイレから戻らず、30分後に首を吊った姿で発見された。翌日、イリノイ州ジョリエットでもハイキングに来ていた男が、湖近くで待つ妻子の元に戻らず、森の中で同じ状態で死んでいるのを発見された。クーパーたちが殺害現場を検証したところ、リンチ殺人だと分かる。しかも犯人によって、無理やりリンチの現場を見せられていた人物がいることも判明。そんな中、犯人はある人物を同行させて、高速沿いのモーテルで次の獲物を見つけていた…。

インディアナ州インディアナポリスにあるクラブの駐車場で、女性の叫び声を聞いて助けようとした男性が、ノドを切られ瀕死の状態で発見された。捜査に向かったクーパーは、女性の拉致事件があったと確信する。地元警察ではすでに2件の拉致事件を抱えていたが、この女性にはまだ失踪届が出ていない。そこで、クーパーたちは別の観点から拉致事件を見直し、さらに多くの失踪者がいることを突き止める。

オクラホマ州タルサで28歳の小学校教師が金属バットで撲殺された。その後、4時間の間に半径3キロ内でさらに2人が殺された。被害者たちが皆、年齢、体重、身長、肌の色が同じでメガネをかけているという共通の特徴に気付いたクーパーたちは、犯人が特定の人物を狙っていると考える。そんな中、犯人は次に襲った被害者の母親からの電話に、自分が息子を殺したと告げる。そこで、クーパーは母親と犯人との接触が鍵になると判断する。

ニューハンプシャー州マンチェスターで、9日間で子供を持つ母親だけを狙う3件の連続誘拐事件が発生。どの事件も子供は無事に現場で発見されていた。その後、森の中で2人の遺体が発見されたが、無残にも胸を切り刻まれている一方で、身なりを美しく整えられていた。凶暴な殺害を取り消したいかのような行動から、犯人の罪悪感の表れではないかとクーパーは分析。まだ見つかっていない3人目の被害者の捜索を急ぐのだが…。

2001年、カリフォルニア州ロサンゼルスで3人の少年を操り、その両親を殺害させたヴェロニカ・デイ。死刑囚となった彼女の弁護士が再審理を請求した。当時プロファイルを担当したFBI長官のフィックラーは、第三者の専門家からの証言を求められクーパーを呼び出すのだが、ヴェロニカの弁護士は異常なほどの自信を持って、フィックラーの証言を"誤り"だと申し立てる。クーパーは長官に向けられた10年前の捜査への疑いを晴らせるのか。

連邦判事の娘、エマと友人が拉致された疑いがあり、クーパーが呼び出された。拉致現場がドラッグの密売場所であることから、捜索願が出ない女性たちを狙った薬絡みの連続犯行とみられ、一緒にいた友人が共犯者である可能性も高まった。そんな中、その共犯者とみなされた友人が拷問を受けた遺体となって発見される。地理的プロファイルの結果、ペイジが容疑者として浮かび上がり、監禁場所は突き止められたが、誘拐された女性たちの姿がどこにも見当たらない…。

クワンティコ内のキャンプ場で海兵隊員が襲われ、顔の半分をズタズタに切り裂かれて殺害される事件が発生した。10日前にもクワンティコに隣接する公園で17歳の家出人が同様に顔面をはぎ取られた遺体で発見された。不思議なことに犯人は被害者たちを殺そうとしていない。生きた組織にこだわっていることから、持ち帰った皮膚を誰かに移植するための犯行ではないかとクーパーは分析する。そんな中、ジョギング中の若い女性がスタンガンで襲われた…。