16歳で母となったエイミー。子供は男の子のジョン。ジョンを一生懸命育てようとするエイミーを助ける周りのベンやリッキー。慣れない子育てに奮闘するエイミーだか突然、母アンが妊娠した事を知る。相手はデビットなのか…。一方、グレースがジャックと初めての夜を過ごしていた頃、(グレースの)父親が出張中に飛行機事故にあったという知らせが届く。

父親の事故はグレースが悪いと責める弟トム。しかもその原因はエイドリアンにあると言う。グレーズは、自分がジャックと関係を持った事で父が死んでしまったと自分を責めるようになり、ジャックに愛されたくないと発言してしまう。エイミーの周りも母の妊娠を発端に騒がしくなっていく。

グレースの力になろうとするジャックだが、グレースは父を自分が殺してしまったと思い込み葬儀に出席する気持ちになれない。エイミーは子育てに少し疲れ、外に出かけるがベンが他の女の子と話しているのを見て関係に疑いを持ってしまう。またその事でリッキーは不自由さを感じるようになる。しかし、グレーズはストーン牧師やリッキーの説得を受け葬儀に出席する決心をする。

父親から夏休みにイタリア、ボローニャのホテルで働く提案を受けるベン。一方、ジョージはグレースに不妊手術は嘘だったと話す。またジャックは浮気を二度としない、お酒をもう飲まないという2つの約束をグレースにする。一方、リッキーはエイドリアンに付あって欲しいと告白する。エイミーは母に自分もイタリアに行く事を相談するが、リッキーはベンを一人で行かせるようにエイミーを説得する。そんな中、デビットはアンにプロポーズをする。

正式に離婚をしていないのにプロポーズを受けようとする母アンを責めるエイミー。妹のアシュリーにアンのお腹の子の父親はデビットだと主張する父ジョージョ。ボローニャに一緒にエイミーについてきて欲しいと思っているベンと一人で行くべきだと意見するリッキー。様々な思いが交錯する中、一人立ちを決心したリッキーは家を出る事を決意し、ベンの父親の精肉店の2階で生活を始めようとする。

ジョージの元に離婚書類が届く。エイミーは学校より夏休みに補習に出るように指示がある。また父が亡くなる前に自分を医師養成研修に参加できるようにしてくれていた事を知るグレース。ヨリを戻そうと考えるジョージだが、そんなジョージにアンは離婚してデビットと結婚することを決めた、とサインを求める。エイミーの部屋でリッキーがジョンを抱いているのを見たベンは一人でのボローニャ行きを決意する。

夏休みが終わり新学期が始まった、妹アシュリーもこの日から登校する。エイミーとベン、グレースとジャック、エイドリアンとリッキーが久々に再会するも三者三様。またアシュリーはグリフィンに入学早々に誘われる。一方、デビットはエイミーに車をプレゼントし気を引こうとするが、それを知ったジョージは怒るもののアンの子供の父親は自分だと主張し、やり直したいとお願いする。

もっとふさわしい相手と交際したかったと言いだすアンにあきれる家族。ベンがいない間にエイミーの部屋を訪れて話を聞いたというリッキー、しかも泊っていったという。その事をエイミーに問い詰めるベン。エイミーとベンが部屋に戻るとジョンを抱くエイドリアンの姿が。怒るエイミーに告げられたのはエイドリアンが隣に引っ越してくる事だった。

自分の兄とジャックが仲良くなって欲しいと願うエイドリアン。ジャックは兄と遊んで仲良くしようとするがうまくいかない。エイドリアンは本当の父親なのにエイミー言いなりになるリッキーを問いただす。また、アンと仲直りすることができたジョージョ、しかも子供は男の子だとわかる。

学校で色々な人から交際を持ちかけられるアシュリー。グレースは禁欲の話をする集会を開こうとする。ジョージはアンに無理をしないように訴え、犬を飼って和ませようとするが、アンは犬はいらないと言う。リッキーと結婚できないと思っているエイドリアンは、夫になる可能性のある人と関係を持ちたいと思い、他の人にも会う事をリッキーに告げる。

リッキーはエイドリアンは関係を持とうとするが拒否され、逆にセラピーに通う事を進められる。ジョージはアンが嫌がっているのでムース(犬)を引きとってもらおうとするが、アンはムースを気に入っていた。関係を修復したジョージとアンだが、アシュリーはエイミーと一緒に住む事を拒否するようになる。また、ジョージはリッキーがアシュリーにまで手を出そうとしていたと疑う。

はっきりとしないリッキーの態度。再婚を考え始めた母と衝突するグレース。新しい生活を始めようとするベイとエイミー。そんな時、母アンの出産が始まる。それぞれがそれぞれの生き方に向かって進もうとするシーズン3の最終話。そしてジョージの身に起こる驚愕のラストとは?