月野うさぎは、今日もねぼうして学校へ急ぐ途中で、小学生にいじめられているおでこにバンソーコーを貼られた黒ネコのルナを助けた。その夜、うさぎのもとへやってきたルナは変身ブローチを渡し、セーラームーンとなって月のプリンセスを探せと、使命を語る。その時、うさぎの耳に親友なるの助けを求める悲鳴が聞こえた。

うさぎは、最近評判の占いハウスにお客を取られて寂しそうにしているジジに恋愛運を占ってもらった。そこで「いつも会っている人に思われている」と言われて、ゲーセンの元基のことだと思いこんで有頂天に。しかし占いハウスへ行ったクラスメイトたちのようすがおかしい。占いハウスが怪しいとにらんだうさぎとルナは…。

深夜のラジオ番組"ミッドナイト・ゼロ"のDJのJダイトーにラブレターを読んでもらった春菜先生が、授業中に眠ってしまった。なるもJダイトーにラブレターを読まれた翌日、教室で眠ってしまう。おかしいと感じたうさぎは、変身ペンで美人アナウンサーに変身してラジオ局へ潜入する。

おフロからあがったうさぎは、体重計にのって悲鳴をあげた。ダイエットに目覚めたうさぎは、なるたちと評判のエステサロンへ向かう。しかしうさぎは、すぐにギブアップ。そのころ、なるたちは、たちまちやせるというシェイプアップ光線を浴びていた。しかし、それはダーク・キングダムのワナだった。

うさぎの弟の進悟は大のネコ嫌い。そこで動物になれるために新種のペット、シャネーラを飼うことになった。しかし進悟は、シャネーラを連れて部屋にとじこもってしまう。そしてシャネーラは、学校でも問題を起こしていた。原因はシャネーラだとペットショップへ調査に向かったうさぎも、シャネーラの目に魅入られてしまった。

うさぎは、怪物に追われているという作曲家の雨出祐介を調べるためミュージシャンに変装してライブハウスへ潜入。そこで演奏する祐介のピアノに、うさぎはうっとり。しかし祐介は妖魔に襲われ、好きな人に贈るための恋の曲が入ったテープを奪われてしまった。うさぎは祐介とともに妖魔を追跡する。

十番中学出身の大人気アイドルの白鳥みかんに影響されて、うさぎとなるはアイドルを目指して特訓開始。しかし、みかんがはじめたシンデレラ・キャラバンに参加した人々がおかしくなりはじめた。次の日曜にキャラバン参加者がショーをすることを知ったうさぎは、会場のシャンシャンプラザへ向かった。

ルナは不思議なエナジーを感じる少女、水野亜美を監視していた。テストのヤマを教えてもらおうと、うさぎは亜美とゲームセンターで遊ぶ。やがて亜美は塾へ向かったが、1枚のディスクを忘れていった。だがルナが解析すると、そのディスクには洗脳プログラムが入っている。はたして亜美は妖魔なのか!?

亜美とショッピングを楽しむうさぎは、時計店で見た黒ネコの目覚まし時計をひとめで気に入ってしまった。お金がなくて泣く泣くあきらめたけど、ママがその時計を買ってきてくれていた。翌朝、亜美がうさぎを迎えにいくと、朝寝坊が得意のうさぎがすでに学校へ!? うさぎだけではない、亜美以外のみんなはなんだか忙しそう。

呪われた路線バスのうわさに、怖がりのうさぎは火川神社へお守りを買いにきた。そこで出会った神社の孫娘のレイは、最近不思議な気配を感じるという。レイは神社の手伝いをしている謎の青年を怪しんでいたのだ。調査中のうさぎもバスごと暗黒へ吸い込まれてしまう。レイは火に祈りを捧げて、ついに謎の原因を突き止めた。

ルナはセーラー戦士が3人になって、いよいよプリンセス探しに全力を出すべきだと考えていたが、手がかりがほとんどない。とりあえず亜美の提案で、最近行方不明者が続出している夢ランドを調査することになった。しかし、何かとケンカばかりするうさぎとレイ。その間に亜美がダーク・キングダムのワナに落ちてしまった。

福引きで一晩の船旅が当たったレイは、亜美といっしょにでかけてしまう。うさぎもカメラマンに変装して船に乗り込む。しかし、このクルーズはジェダイトのワナだった。クルージングを楽しむ恋人たちからエナジーを奪おうとしていたのだ。エナジーを吸い取られて次々に倒れる恋人たち。最後に残ったのは、恋人のいないレイと亜美だった。